Quels sont les liens entre un photographe de presse retrouvé tabassé à mort et un commissaire principal, ancien du SAC, la sulfureuse police parallèle du gaullisme? C'est ce que cherchent à démêler deux policiers de terrain, Joubert et son coéquipier, Yannakakis. Marques bleues est un chassé croisé tumultueux entre les barricades du Quartier latin, les immeubles cossus du XVIè arrondissement et les rives d'Oran